Impresionado con la habilidad cada vez mayor de Kor, su abuelo decide que ha llegado el momento de legarle a Kor un arma muy poco habitual llamada Soma. Sin embargo, Kor descubre que su Soma no es solo un arma de destrucción, sino que también puede usarla para curar el spiria enfermo de otras personas. El spiria es la personificación del corazón y del alma y juega un papel clave en el mundo del juego, ya que es la fuerza más poderosa que se conozca. Sin embargo, por poderoso que pueda ser el spiria, su fuerza puede verse alterada por emociones tan intensas como la ira, el odio, el miedo o incluso el amor. Por tanto, los usuarios de Soma deben tener spiria muy poderosos para soportar dichas emociones.
Los jugadores también conocerán a la protagonista femenina de la historia, Kohaku Hearts, quien está buscando un arma Soma y huyendo de una misteriosa bruja junto con su hermano, Hisui Hearts. Una serie de trágicos acontecimientos acaba llevando a Kor, Kohaku y Hisui a una gran aventura en la que podrán desentrañar los misterios del núcleo de spiria, conocerán a nuevos compañeros de aventuras y salvarán al mundo de las garras de un futuro oscuro y ominoso.
